FDEC contribuye al desarrollo económico, empresarial, tecnológico, comercial y social de Canarias, proponiendo las medidas políticas y jurídicas que favorezcan la competitividad de las empresas y el empleo de los ciudadanos.
Los órganos de FDEC son los encargados de ofrecer las propuestas y mantener el diálogo y la negociación con la administración y otros organismos, así como con los sindicatos y otros agentes sociales.
El órgano supremo de FDEC es la Asamblea General, compuesta por los representantes de las organizaciones zonales y sectoriales, que cada dos años elige al Presidente y a la Junta Directiva. La Junta designa a los miembros del Comité Ejecutivo y al Secretario General, a propuesta del Presidente. De la Junta Directiva dependen las Comisiones, Comités y Consejos, que actúan temporal o permanentemente como órganos de estudio y consulta de la Federación.